Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYAP1Q96A49 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms