Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms