Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms