Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD16

BICD2, Protein bicaudal D homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD2Q8TD16 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BICD2Q8TD16 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD2Q8TD16 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms