Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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ZNF548Q8NEK5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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