Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms