Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD53Q8N9V6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD53Q8N9V6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD53Q8N9V6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD53Q8N9V6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD53Q8N9V6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD53Q8N9V6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD53Q8N9V6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD53Q8N9V6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD53Q8N9V6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms