Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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LRRC71Q8N4P6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC71Q8N4P6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC71Q8N4P6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms