Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms