Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms