Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms