Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms