Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.58■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.58■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.56■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.56■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCQ7RTU9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms