Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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USP53Q70EK8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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USP53Q70EK8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP53Q70EK8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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