Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms