Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms