Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms