Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms