Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms