Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RWDD4Q6NW29 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms