Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms