Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
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