Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms