Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RNF123Q5XPI4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms