Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms