Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPRD2Q5VT52 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RPRD2Q5VT52 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPRD2Q5VT52 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms