Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNT1Q5JUK3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms