Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms