Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D3Q587I9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D3Q587I9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms