Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALFQ53S48 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms