Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms