Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms