Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFNL1Q499Z3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFNL1Q499Z3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms