Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms