Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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