Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms