Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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