Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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