Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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