Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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CNGA3Q16281 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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CNGA3Q16281 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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CNGA3Q16281 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CNGA3Q16281 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CNGA3Q16281 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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