Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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