Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1EQ15878 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms