Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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TAF13Q15543 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms