Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDSNQ15517 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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