Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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SIX1Q15475 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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SIX1Q15475 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SIX1Q15475 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SIX1Q15475 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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SIX1Q15475 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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