Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
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