Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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