Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 MMP25-AS1-207ENST00000573878 483 ntTSL 312.36□□□□□ -0.436e-9■■■■■ 30.5
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PCBP2Q15366 MMP25-AS1-205ENST00000572930 420 ntTSL 38.55□□□□□ -1.046e-9■■■■■ 30.5
PCBP2Q15366 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.216e-9■■■■■ 30.5
PCBP2Q15366 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.461e-37■■■■■ 30.5
PCBP2Q15366 EIF1B-202ENST00000462088 873 ntTSL 25.83□□□□□ -1.481e-37■■■■■ 30.5
PCBP2Q15366 EIF1B-204ENST00000488260 637 ntTSL 25.58□□□□□ -1.521e-37■■■■■ 30.5
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PCBP2Q15366 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 30.5
PCBP2Q15366 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-25■■■■■ 30.5
PCBP2Q15366 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.253e-25■■■■■ 30.5
PCBP2Q15366 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.273e-25■■■■■ 30.5
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PCBP2Q15366 METTL17-224ENST00000557550 1529 ntTSL 510.94□□□□□ -0.663e-25■■■■■ 30.5
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PCBP2Q15366 METTL17-203ENST00000553389 952 ntTSL 29.14□□□□□ -0.953e-25■■■■■ 30.5
PCBP2Q15366 METTL17-208ENST00000554354 249 ntTSL 56.72□□□□□ -1.333e-25■■■■■ 30.5
PCBP2Q15366 CUTC-204ENST00000493385 612 ntTSL 36.45□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 30.5
PCBP2Q15366 TFG-205ENST00000479672 776 ntTSL 322.05■■□□□ 1.127e-7■■■■■ 30.5
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PCBP2Q15366 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.147e-7■■■■■ 30.5
PCBP2Q15366 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 419.18■□□□□ 0.668e-7■■■■■ 30.5
PCBP2Q15366 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.521e-8■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.051e-8■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 RCOR3-211ENST00000528926 1497 ntTSL 212.76□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.964e-40■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 CACUL1-206ENST00000493518 3217 ntTSL 1 (best)15.14■□□□□ 0.012e-12■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.532e-12■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 CACUL1-202ENST00000477583 432 ntTSL 1 (best)3.47□□□□□ -1.852e-12■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.79e-7■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.569e-7■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 TEAD4-208ENST00000544666 567 ntTSL 511.68□□□□□ -0.549e-8■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 PPWD1-206ENST00000508982 838 ntTSL 211.31□□□□□ -0.64e-12■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 PPWD1-207ENST00000510930 2019 ntTSL 210.28□□□□□ -0.764e-12■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 PPWD1-213ENST00000515447 580 ntTSL 49□□□□□ -0.974e-12■■■■■ 30.4
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PCBP2Q15366 PPWD1-203ENST00000503435 592 ntTSL 48.38□□□□□ -1.074e-12■■■■■ 30.4
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PCBP2Q15366 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.264e-12■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 PPWD1-202ENST00000502703 570 ntTSL 45.93□□□□□ -1.464e-12■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 PPWD1-204ENST00000505380 829 ntTSL 34.64□□□□□ -1.674e-12■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-20■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 PDE4D-208ENST00000502484 2478 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.126e-7■■■■■ 30.4
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PCBP2Q15366 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 30.4
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PCBP2Q15366 EHD1-209ENST00000484846 3469 ntTSL 212.78□□□□□ -0.361e-31■■■■■ 30.4
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PCBP2Q15366 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.481e-31■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 BCAS3-222ENST00000589222 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 BCAS3-217ENST00000588462 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 30.4
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PCBP2Q15366 NRDE2-205ENST00000556189 2937 ntTSL 1 (best)10.87□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 BCAS3-201ENST00000390652 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 BCAS3-202ENST00000407086 3496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 BCAS3-203ENST00000408905 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 HCFC1R1-206ENST00000574151 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 BCAS3-231ENST00000592848 918 ntTSL 58.77□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 BCAS3-208ENST00000586241 558 ntTSL 56.13□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 BCAS3-228ENST00000592393 569 ntTSL 55.22□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 ROCK2-204ENST00000431087 729 ntTSL 37.28□□□□□ -1.244e-8■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 PHF8-205ENST00000396282 3344 ntTSL 59.62□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.154e-7■■■■■ 30.4
PCBP2Q15366 ZFAND3-202ENST00000373389 531 ntTSL 510.27□□□□□ -0.779e-7■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.091e-19■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.782e-7■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 FBXO31-204ENST00000565593 2717 ntTSL 519.37■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.225e-7■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 DNTTIP1-205ENST00000456939 1073 ntTSL 518.66■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 DNTTIP1-203ENST00000435014 930 ntTSL 59.5□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 DNTTIP1-202ENST00000415790 591 ntTSL 39.28□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 PCSK6-203ENST00000557794 1196 ntTSL 510.89□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.592e-11■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 ACTN4-207ENST00000495553 586 ntTSL 59.19□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 RAI1-204ENST00000489697 1570 ntTSL 315.33■□□□□ 0.059e-8■■■■■ 30.3
PCBP2Q15366 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.026e-6■■■■■ 30.3
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