Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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