Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARHGEF6Q15052 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF6Q15052 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms